传统认知中,MYC是驱动癌细胞无限增殖的“总开关”——它作为转录因子,结合在DNA上,对大量基因的表达产生积极影响,形成肿瘤的特征性表达谱。除此之外,MYC还可以帮助癌细胞逃避免疫系统的监视:在胰腺癌模型中,敲除MYC能引发肿瘤消退,但这种效应在免疫 ...
NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析 (重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘 ...
近年来,高通量测序技术已经彻底改变了生物学和医学等学科的研究方式,使得在单碱基水平上对大量样本的核苷酸序列进行检测成为可能。 近年来,高通量测序技术已经彻底改变了生物学和医学等学科的研究方式,使得在单碱基水平上对大量样本的核苷酸序列 ...
在遗传学研究中,准确预测 DNA 变异对基因调控的影响至关重要。研究人员开展了从 DNA 序列预测 RNA-seq 覆盖度的研究。他们开发的 Borzoi 模型能精准预测,还可解析调控机制,这有助于理解遗传关联影响性状的机制,推动遗传学发展。 在生命科学的广阔领域中 ...
尽管RNA-seq有许多优势,但许多研究者还是在继续使用芯片,尤其是样本量比较大的研究。芯片在临床研究中也很吃香,因为它的数据处理又快又简单。 DNA芯片(上图左侧)由附着在表面的核酸探针组成。首先,从样品中提取RNA并转化为互补DNA(cDNA),用荧光 ...
来自犹他大学健康中心等机构的研究人员通过研究,利用一种名为PANDORA-seq的先进测序技术捕捉到了小鼠和人类精子中随着衰老而发生剧变的RNA世界,发现精子头部中特定的小RNA长度会随父龄增长而变长 ...
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