近期，香港城市大学李润生团队在bioRxiv预印本平台发表了一项系统比较研究，题为《When CycloneSEQ meets Oxford Nanopore Technologies: a performance comparison of contemporary nanopore DNA sequencing platforms》（Liu et al.）。该研究通过六种细菌样本的全基因组测序 ...
本研究针对单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据整合中批次效应(batch effect)干扰和批次特异性细胞类型识别难题，开发了基于循环对比学习(recycle contrastive learning)和变分自编码器(VAE)的整合方法CYCLONE。该方法通过周期性更新互最近邻对(MNN)和K最近邻对(KNN)构建高置信度正 ...
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