不过，《植物的欲望》也有一些争议性内容。该书有关大麻的一章，试图为中国人心目中的毒品植物翻案，恐怕很多人不易接受。有关马铃薯的一章，则采取了质疑基因修饰技术（俗称“转基因技术”）的立场，在科学界颇受非议。